Лауреаты в номинации «Лучший проект МФЦ» определяются по двум основным категориям: «Лучшая инициатива МФЦ», в рамках которой выбираются новаторские проекты, определяющие вектор развития МФЦ в субъектах Российской Федерации, и «Лучшая практика МФЦ», в которую подаются проекты по совершенствованию направлений деятельности МФЦ, существующих в практике большинства МФЦ субъектов Российской Федерации.
Оценка проектов осуществляется по таким критериям, как актуальность, новизна, эффективность, социальная значимость и другим, при этом центральная конкурсная комиссия учитывает мнения экспертного сообщества МФЦ. На конкурс за 2015–2021 годы было подано более 200 проектов.